尖銳濕疣的潛伏期3周到8個月，平均3個月，多見于性活躍的青、中年男女，發病高峰年齡為20～25歲，病程平均在3～5個月的男女患者，在性接觸后不久即發病，而病程平均12個月的男性患者，其性接觸者可不發病。多數患者一般無癥狀。損害大小及形狀不等。可僅為數個，亦可為多數針頭樣大的損害：在陰肛部可長成大的腫瘤樣物，有壓迫感。有惡臭味。有時小的濕疣可出現陰部痛癢不適，患者可出現尿血和排尿困難。直腸內尖銳濕疣可發生疼痛、便血，而直腸內大的濕疣則可引起里急后重感。

　　男性患者好發于包皮系帶、冠狀溝、包皮、尿道、陰莖、肛門周圍和陰囊。病初為淡紅或污紅色粟狀大小贅生物，性質柔軟，頂端稍尖，逐漸長大或增多。可發展成乳頭狀或囊狀，基底稍寬或有帶，表面有顆粒。在肛門部常增大，狀如菜花，表面濕潤或有出血，在顆粒間常積存有膿液，散發惡臭氣味，搔抓后可繼發感染。位于濕度較低干燥部位的生殖器疣，損害常小而呈扁平疣狀。位于濕熱濕潤部位的疣常表現為絲狀或乳頭瘤狀，易融合成大的團塊。有嚴重肝病的患者濕疣可增大。妊娠可使濕疣復發或生長加快。

　　女性損害常累及從宮頸到肛門所有鱗狀上皮覆蓋區域的多個部位，呈多中心病變，嚴重者可累及宮腔，宮頸濕疣多發生在宮頸移行區內，單發或多發，可融合，有點類似于乳頭狀上皮增生，但可在半透明的上皮下見到規則的管袢，依靠帶放大鏡的陰道鏡則可以發現約1/3患外陰濕疣的女性有陰道濕疣，陰道濕疣常多發，多見于陰道的上1/3和下1/3部，損害表現為高起，稠密的白色突起，有時呈一凸起無血管分布的角化斑塊，陰道濕疣的特點之一是可自發性消退，特別是在宮頸和外陰的病變治療之后，外陰濕疣最常見，一般為柔軟，粉紅或灰白色，有血管的無蒂贅生物，表面具有多發的指狀突起，初發于潮濕和性交摩擦部位，如陰道口，陰唇，尿道口，處女膜，也可擴散到外陰其他部位或肛周，非黏膜區的濕疣則表現更為角化，類似于尋常疣，女性尖銳濕疣大多數無癥狀，有時可有瘙癢，疼痛，性交后出血和陰道分泌物。

　　嬰兒和青春期的男女兒童可發生肛周濕疣，女性兒童可有外陰濕疣，其傳染性很難判斷，是否由于人類乳頭瘤病毒的長期潛伏，性虐待或通過日常用具傳播不能確定，國外有專家指出，尖銳濕疣是兒童性虐待的標志。

　　喉部尖銳濕疣大多數病例報告發生在嬰兒，主要由HPV6、11型引起，病毒傳染途徑是經胎盤，圍生期或生后感染還不清楚。成人喉部尖銳濕疣則和口交有關，巨大尖銳濕疣又稱癌樣尖銳濕疣，表現為疣體過度增生，類似鱗癌，但組織學示良性病變，與HPV6感染有關，妊娠期尖銳濕疣生長快，脆性增加，應去除。鑒于剖宮產預防新生兒感染價值不明，常規仍應采用陰道分娩，僅在疣體增大到阻塞產道或可能導致大出血時才推薦剖宮產。

　　大量流行病學資料表示，人類乳頭瘤病毒感染(主要是高危型人類乳頭瘤病毒，如HPV16、18型)與生殖器癌的發生有密切的關系，如宮頸癌、陰莖癌等。

　　尖銳濕疣治療后一般預后良好。但不論何種方法治療，均可能復發。