1、治療藥物選擇不當，淋球菌對之耐藥。

　　2、男性尿道再感染，性伙伴沒有經過治療。

　　3、患者未按醫囑用藥，飲酒以及辛辣的食物可以影響男性尿道炎的診治療效。

　　4、患者只被給予抗一種病原體的藥物，忽視了混合感染的情況，例如，合并沙眼衣原體或者是支原體感染而未得到治療。

　　5、男性中也有滴蟲引起的尿道炎。

　　6、某些細菌感染導致非特異性尿道炎。

　　7、男性可以由于局部抵抗力下降而導致前列腺炎。

　　8、尿道粘膜炎癥性損害如水腫、增生尚未恢復，或者局部神經受牽拉，可以出現尿道炎癥狀。